和此前的汽車產品稅費征收相比，燃油稅的開征本身就是一種公平的象征，從根本上，也是一種國家公平的體現，這里面包含了社會效率的提高和持續發展的思想。但同時值得注意的是，在燃油稅征收過程中，制度的公平和程序的公平也同樣重要，而這是保證燃油稅引導社會消費朝著良性方面發展的不可忽視的因素。
事實上，若稅率制定合理，并以汽車跑的越多、耗油越多、繳納燃油稅就越多的原則來考量，這個稅種將在相當程度上確保車主利益的公平性，尤其是對于小型轎車的車主更是一大利好消息。
燃油稅稅率應該定多少？
是否制定全國統一的燃油稅標準？私人用車和行業用車是否有所區別？出租車燃油稅率如何定？在這些具體的問題面前，燃油稅的征收成為一個紛繁浩大的系統工程。
以燃油稅稅率為例，25%為燃油稅稅率臨界點是目前業界的一個共識。據計算，車主每月用90號汽油110升，一年是1320升；養路費110元/月，一年是1320元，燃油稅為養路費/用油量，即1320元/ 1320升＝1元/升。假定每升汽油的燃油稅以1元計算，其稅率大約為27%。如果稅率低于25%，費改稅后，用車費用會降低；如果稅率大于25%，費用就會比以前提高。
但是隨著汽油價格不斷上升，這個稅率將有被調低的可能。在保障消費者利益的前提下，如何協調收繳養路費的交通部門與稅務等部門之間的利益關系就成為一個現實的難題。
同樣，統一稅率能否體現公平性也是一個重要的問題。國家一旦開征燃油稅，其稅率必然會有一個統一標準。但我國現實的經濟發展不均衡，以及交通基礎設施建設等硬件方面的差別將造成同樣一種燃油稅在各地實施的不同結果。在取代了養路費后，過路費、過橋費仍舊存在將會對燃油稅的實際效率有所挑戰。取代后兩者，則統一的燃油稅稅率對于一些公路建設相對落后地區的私家車主而言是相當不公平的。而解決之道，除了合理調整燃油稅自身所囊括的現有稅費種類之外，是否可以在不同的地區按照經濟發達程度、交通設施情況等因素來制定不同的稅率？
因此，燃油稅出臺需要建立一定的協調機制，需要制度建設擁有充分的彈性和柔性，才能確保兼顧各方用油群體的利益。
